1x06 26 сентября 2005 года Riots, Drills and the Devil. Part 1 / Беспорядки, сверло и дьявол. Часть 1 Майкл ломает систему кондиционирования, чтобы саботировать бунт. Заключённые пытаются взять в заложницы Сару Танкреди. Линкольна пытаются убить.

1x07 3 октября 2005 года Riots, Drills and the Devil. Part 2 / Беспорядки, сверло и дьявол. Часть 2 Сукре и Абруцци сверлят стену, а Майкл отправляется на помощь Саре. Вероника и Ник продолжают расследование.

1x08 24 октября 2005 года The Old Head / Старый конь Майкл узнает, что в тюрьме произошла перепланировка. Чтобы попасть в комнату отдыха охраны, он решает пригласить в группу беглецов Чарльза Весморленда. Нику и Веронике угрожают.

1x09 31 октября 2005 года Tweener / Изгой Абруцци теряет свое место руководителя тюремных работ. Майкл пытается защитить молодого заключённого по прозвищу Изгой. Си Ноут наводит справки о Майкле.

1x10 7 ноября 2005 года Sleight of Hand / Ловкий трюк Тюремные работы снова в руках Абруцци — Майклу удался ловкий трюк. Си-Ноут присоединяется к беглецам. Вероника, Ник и Эл-Джей прячутся от «агентов».

1x16 3 апреля 2006 года Brother’s Keeper / Братская забота Эпизод переносит на 3 года ранее заключения Майкла и показывает жизнь некоторых основных персонажей до Фокс Ривер. Идея серии вертится вокруг убийства, приведшего Линкольна к заключению, а также причин, по которым Майкл решил спасти брата.

1x17 10 апреля 2006 года J-Cat / Нервный срыв За отказ от ответа начальнику тюрьмы по поводу ожога, Майкла отправляют в одиночку. Сукрэ должен убедиться, что план побега не был обнаружен. Вероника, Ник и Эл Джей возвращаются в Нью Гларус в поисках информации. Эл Джей решает отомстить.

1x18 17 апреля 2006 года Bluff / Блеф В психиатрическом отделении тюрьмы Майкл пытается восстановить потерянную часть татуировки. Гари выставляет на аукцион пустующую камеру Майкла и Сукре, оставшимся членам команды придется сделать максимальную ставку, чтобы о плане побега никто не узнал.

1x19 24 апреля 2006 года The Key / Ключ Линкольн спасён отцом из автомобильной аварии, также узнает о причинах, по которым на него повесили убийство Стедмена. Для окончания плана побега Майклу требуется ключ от лазарета, но ему не удаётся украсть его у Сары. Абруцци возвращается в тюрьму.

1x20 1 мая 2006 года Tonight / Сегодня ночью После того как Беллик обнаруживает дыру, команда решает бежать как можно скорее. Без времени и альтернатив Майкл насильно втягивает Сару в план. Изгоя принимают в команду. Вероника обнаруживает улики ведущие в Блэкфут, штат Монтана.

2 сезон сериала

2x01 21 августа 2006 года Manhunt / Преследование Агент ФБР Александр Махоуни руководит поисками сбежавшей восьмерки и через ТВ объявляет беглецов самыми разыскиваемыми преступниками США. Следуя татуированному плану Майкла беглецы извлекают из пустой могилы документы и одежду. Беллик и Махоуни следуют за ними по пятам, им тоже удалось разгадать следующий шаг Майкла. Сара пришла в себя после передозировки наркотиков, она подозревается в помощи беглецам. Вероника нашла на ранчо в Монтане живого Стедмана Теренса (в убийстве, которого обвиняют Линкольна), она вызывает полицию, но приезжают агенты Компании и убивают её. Ти-Бэг находит ветеринара и заставляет его пришить ему отрубленную руку.

2x02 28 августа 2006 года Otis / Отис Майкл и Линкольн пытаются освободить Эл-Джея прямо в здании суда, но Махоуну удаётся помешать им. Сукре, Абруцци и Си-Ноут уходят своими дорогами. Беллика выгоняют со службы после показаний Гэри. Начальник Поуп в знак протеста подает в отставку. Ти-Бэг убивает ветеринара. Тем временем, Изгой присоединяется к студентке колледжа, направляющейся на весенние каникулы в Юту.

2x06
27 сентября 2006 года Subdivision / Команда Майкл, Линкольн, Ти-Бэг и Изгой, чтобы проникнуть в дом под которым закопаны деньги Весморланда, представляются рабочими-электриками, посланными устранять аварию. К их «раскопкам» присоединяются неожиданно появившиеся Сукре и Си-Ноут. Махоуни отправляется в Юту за беглецами и ему удаётся схватить Изгоя. Отец предупреждает Сару об опасности Келлермана.

2x07
2 октября 2006 года Buried / Клад Линкольн отправляется на встречу со своим сыном Эл-Джеем, которого только что выпустили из под ареста в Аризоне. Остальные беглецы обнаруживают под фундаментом дома пять миллионов. Сукре забирает деньги себе, угрожая оружием. Изгой пытается направить Махоуни по ложному следу. Оставшись наедине с Изгоем, Махоуни убивает Изгоя. Кондидатуру отца Сары отзывают с должности вице-президента. Сара находит своего отца (губернатора Талкреди) повещеным в его кабинете. В его карманах она находит ключ.

2x08
22 октября 2006 года Dead Fall / Капкан Оказывается, что отобрать клад у Си-Ноута и Ти-Бэга было идеей Майкла. Сукре и Майкл обнаруживают, что им достался пустой рюкзак. Деньги украл Ти-Бэг. Линкольну удаётся скрыться от преследования вместе с Эл-Джеем. Компания пытается инсценировать самоубийство Сары.

2x09
30 октября 2006 года Unearthed / Раскопка Саре удаётся разгадать ребус из оригами, и она отправляется на встречу с Майклом в Нью-Мехико, но её преследуют Келлерман и Махоун. Майкл встречается с женой Махоуни, чтобы узнать о судьбе Оскара Шейлза. Линкольна и Эл-Джей арестовывает полиция. Беллик и Гэри ловят и пытают Ти-Бэга.

2x10
6 ноября 2006 года Rendezvous / Место встречи Майкл и Сара встречаются в условленном месте в Нью-Мехико, а Махоун следит за ними. Линкольн и Эл-Джей от полиции освобождают друзья отца, и привозят их к нему. Сукре пытается связаться с Марикруз по телефону. Беллик и Гэри пытками отбирают у Ти-Бэга ключи от ячейки с деньгами. Когда они забирают деньги Гэри избивает Беллик и убегает с деньгами. Махоуни предупреждает Майкла, что не оставит его пока не убъёт его, даже в Панаме.

2x14
22 января 2007 года John Doe / Неопознанный труп Майкл, Линкольн и Келлерман приезжают в Монтану и находят там Терренса Стедмана. В Фокс Ривер заключённые третируют Беллика. Си-Ноут продолжает свое путешествие с дочерью. Майкл звонит в новостной канал и сообщает свое местонахождение. В ожидании приезда полиции и репортёров у Стедмана сдают нервы и он совершает самоубийство. Теперь он - неопознанный труп, а братья лишились самого главного козыря в этой партии.

2x15
29 января 2007 года The Message / Послание Майкл, Линкольн и Келлерман похищают оператора канала новостей и с его помощью записывают и предают на телевидение обращение, где говорят о своей невиновности и о преступлениях "Компании". В этом обращении Майкл зашифровывает послание для Сары. Беллик попадет в лазарет после ночного избиения. Махоуни приезжает в Фокс Ривер к Бэллику и просит помочь с расшифровкой послания. Двое несовершеннолетних подростков просят Психа купить им пива в ближайшем магазине, а Сукре угоняет машину, чтобы добраться до Мэрикруз. Псих убивает отца одного из подростков. Сара расшифровывает послание Майкла. Понимая, что она не успеет приехать в место встречи вовремя, Сара связывается с Майклом по телефону. Ти-Бэг наконец-то находит любовь своей жизни - Сьюзи Холлэндер, но та совершенно не рада его видеть.

2x16
5 февраля 2007 года Chicago / Чикаго Сара встречается с братьями. Её ждет сюрприз в лице Келлермана. Майкл, Сара, Линкольн и Келлерман направляются в Чикаго. По дороге Сара не справляется с эмоциями и делает попытку убить Келлермана. Ти-Бэг держит Сьюзи и ее детей в заложниках. Си-Ноут с дочерью становятся свидетелями ограбления в придорожном кафе, им чудом удается избежать встречи с полицией. Бил Ким пытается манипулировать Келлерманом, играя на его личной привязанности к президенту Рейнолдс. Махоун вытаскивает Бэллика из тюрьмы, что бы тот помог ему найти всех оставшихся беглецов и сделать «грязную работу». Бэллик находит Психа и загоняет его в угол. Приехавший Махоуни подговаривает Психа совершить самоубийство. Сара и Майкл признаются в любви друг другу.

2x20
19 марта 2007 года Panama / Панама Сара сдается ФБР, чтобы позволить Линкольну и Майклу скрыться в Панаме. Си-Ноут жив. Он соглашается дать показания в деле против Махоуни. Статус последнего в ФБР резко меняется. Ким предлагает Махоуни последний вариант спасения его карьеры и жизни – отправится в Панаму на поиски братьев и вовлечь их в новый план «Компании», который не предполагает смерти братьев, так как для него нужны все «действующие лица». Ти-Бэга ловит полиция, и по приказу "Компании" он отправляется в Панаму. Беллик и Сукре идут по его следу. Махоуни связывается с Майклом через форум europeangoldfinch.net, притворившись Сукре, и предлагает приехать в отель в столице Панамы, в котором уже поселился Ти-Бэг. Майкл поддаётся на уловку. Он бросает Линкольна одного и отправляется в Панама-Сити с целью поймать Ти-Бэга и сдать его властям, чтобы хотя бы частично очистить свою совесть.

2x21
26 марта 2007 года Fin del camino / Конец пути В США над Сарой Танкреди идет суд. Её обвиняют в помощи организации побега и содействии беглым преступникам. Саре грозит 12 лет в тюрьме строго режима. Пол Келлерман тщательно готовится к самоубийству, но его пистолет даёт осечку. Он принимает неожиданное решение дать показания по делу Сары. Сара и Линкольн полностью оправданы. Сару освобождаю в зале суда, а Келлермана берут под стражу. А тем временем в Панама-Сити Майкл сталкивается с Белликом и Сукре, а затем замечает наблюдающих за отелем агентов. Махоуни присоединяется к преследованию Ти-Бэга, но на него нападает Линкольн. В завязавшейся драке Махоуни удаётся победить и он приковывает Бэроуза наручниками к трубе. Ти-Бэг действует по плану «Компании» и заманивает Майкла в ловушку. Приехавшая полиция арестовывает Бэллика, а Ти-Бэгу удается скрыться. Майкл и Сукре следуют за ним. Им удаётся поймать Ти-Бэга, но по дороге в полицию, в машине, Ти-Бэг втыкает Сукре отвертку в плечо и автомобиль переворачивается. Майкл вызывает скорую помощь для Сукре, а сам спешит в лес за Ти-Бэгом. В заброшенном доме между Майклом и Ти-Бэгом происходит схватка. Майкл одерживает верх и скрывается с пятью миллионами в рюкзаке. Ти-Бэга арестовывает полиция. Махоуни звонит Майклу и предлагает сделку - 5 миллионов и яхту в обмен на Линкольна. Майкл должен сделать непростой выбор.

2x22
2 апреля 2007 года Sona / «Сона» Майклу удается вытащить Линкольна из рук Махоуни и подставить его. Махоуни обвиняют в контрабанде наркотиков, что по панамским законам очень серьезное преступление. Сукре сбегает из больницы, чтобы найти Беллика и узнать где тот держит Марикруз, но по дороге он теряет сознание и падает на асфальте, истекая кровью. Келлермана перевозят в тюрьму, по дороге водитель останавливается и заднюю дверь микроавтобуса распахивают люди в масках. Слышны выстрелы, но судьба Келлермана не ясна. Майкл и Линкольн встречаются с приехавшей в Панаму Сарой и втроём готовятся уплыть подальше из этих мест,но появляется агент Ким и рушит хэппи-энд всей истории, который был так близок. Ким скидывает рюкзак с пятью миллионами в воду и целясь в Линкольна говорит, что «Компания» нуждается только в одном из братьев. Сара стреляет в Кима. В этот момент приезжает полиция. Линкольну удается сбежать. Не видя другого выхода из ситуации, Майкл берет вину Сары на себя и отправляется в тюрьму. Линкольн теряет след Сары. Майкла и Махоуни привозят в самую гадкую тюрьму Панамы «Сона». В коридоре Майкл натыкается на избитого до полусмерти Беллика. Тем временем в США представители «Компании» ведут разговор о том, что побег Майкла из «Соны» – это как раз то, что им теперь нужно...

3x04
8 октября 2007 года Good Fences / Лазейка Сьюзан Би за попытку освободить Сару и Элджея присылает Линку,в коробке отрезанную голову Сары. Майкл просит Линка попросить помощи у могильщика. Во время переговоров могильщика убивает Сьюзан Би. Из за «ломки» Махоуни видит мертвого Психа,просящего убить Майкла. Личеро назначает Ти Бэга новым наркоторговцем. Беллик рассказывает «королю» про план Майкла бежать из тюрьмы. Махоуни угрожает Майклу, что убьет его, если тот попытается его обмануть. Сукрэ становиться новым могильщиком.

3x05
23 октября 2007 года Interference / Помехи Майкл, Уистлер и Махоуни продолжают работать на планом побега. Майкл достает бинокль и с его помощью следит за часовыми. Увидев блик от бинокля, охранники решают, что из тюрьмы за ними следят в оптический прицел оружия и врываются в тюрьму. Найдя в камере Майка бинокль, охранники запирают ее вместе с частью плана побега. В тюрьме появляется новый заключенный — Тиг. Он называет Уистлера МакФаденом и утверждает, что видел его в 98-м в Ницце вместе с послом. Уистлер все отрицает.

3x06
5 ноября 2007 года Photo Finish / Фотофиниш Майкл не доверяет словам Уистлера, и интересуется у Тига, правду ли он сказал на счет него. В тот же день Тига находят мертвым с перерезанным горлом, и подозрения в его убийстве падают на Уистлера. Теодор хочет подставить Семи, правую руку Личеро, подкинув улику против него на место преступления. Майкл находит в камере Алекса окровавленный нож и с этой уликой идет к Личеро, но они не успевает схватить Алекса, так как его выпускают из Соны и депортируют в США в обмен на показания против президента Рейнальдс. Майкл узнает о смерти Сары и в отчаянии бросает вызов Уолтеру.

3x10
22 января 2008 года Dirt Nap / Заживо погребённый Семи устраивает переворот, занимает место Личеро и устанавливает награду за поимку Майкла. Бэгвелл через Беллика предпринимает неудачную попытку покончить с Семи. Люди Семи находят тоннель, в котором скрывается Майкл. Заманив Семи в ловушку, Майкл осыпает на него тоннель, а Личеро, разделавшись с остальными людьми Семи вновь возвращается ко власти. Линкольн с помощью Сукре подбрасывает в машину Сьюзен взрывчатку. В это время Сьюзен сообщает Сукре, что она догадывается об их с Линкольном замысле и угрожает убить Марикруз.

3x11
5 февраля 2008 года Under and Out / Выход — внизу Люди Компании захватывают Софию. Шантажируя Сукре, Сьюзен узнает про планы Линкольна. Из-за дождя Майкл переносит дату побега — теперь они должны выбраться как можно скорее, пока не обрушится тоннель. Бэгвелл, Личеро и Беллик объединяются против Майкла с Уистлером и решают бежать первыми. Когда к побегу все готово, все замираю на своих позициях в ожидании, когда отключат свет.

3x12
12 февраля 2008 года Hell or High Water / Чрез тернии
Как только выключился свет, Бэгвелл, Личеро и Беллик вышли на нейтральную полосу, но свет внезапно включился и их поймали. Личеро ранили. Пока охранники считали людей и искали тоннель, остальные участники побега успевают выбраться за пределы тюрьмы. Сукре арестовывают. Отец парня-баскетболиста приезжает за беглецами на лодке. Гретхен вычисляет, где они находятся, но они успевают оторваться. Братья, Уистлер и Махоуни приезжают на склад. Уистлер сбегает.

Сезон 4 (2008—2009)

4x01
1 сентября 2008 года Scylla / Сцилла
Майкл стоит в комнате у зеркала и застегивает рубашку. Короткие флешбеки из третьего сезона иллюстрируют его воспоминания — заключение в «Соне», убийство Сары, людей Компании — Уистлера и Гретхен. Он смотрит на стену своей квартиры, на которой висят множество планов зданий, карт, фотографий. Майкл подписывает письмо, которое должно быть найдено в случае его смерти.

Уистлер и Гретхен едут в машине, Махоуни в костюме водителя везет их. Они приезжают на светский прием, Гретхен и Уистлер выходят их машины и направляются ко входу, а тем временем Майкл следит за ними из квартиры с помощью бинокля. Они заходят, Уистлер уходит в одну из комнат, за ним следит незнакомый мужчина.

Майкл под видом официанта проходит внутрь, переодевается и берет с собой пистолет. Уистлер встречается с мужчиной, которого зовет Джейсон, покупает у него карту памяти. После этого он убивает Джейсона и его охранника, затем уходит в подсобку и начинает копировать карту с помощью небольшого специального устройства. В это время входит Майкл и, угрожая Уистлеру пистолетом, требует, чтобы Гретхен пришла. Гретхен входит, и Майкл уже готов ее убить в отместку за смерть Сары, но она утверждает, что Сара жива и требует отдать пистолет, в обмен на информацию о местонахождении девушки. Майкл соглашается, и они выходят из здания. Выходя, Уистлер кладет что-то в газету, и оставляет в зале, где проходил прием. Затем газету берет мужчина, следивший за ним.

Гретхен приезжает в пустыню Калифорнии на встречу с генералом. Тот говорит ей, что карта фальшивая, и что она не справилась с заданием. Гретхен пытается оправдаться, но генерал не слушает и кивком головы отдает приказ. Из машины выходит афроамериканец в чёрном костюме. Гретхен пытается уговорить его и предлагает деньги, мужчина поднимает пистолет...